Une erreur du logiciel et les actions des services terrestres qui ont suivi pour établir la liaison avec l'engin spatial Phobos-Grunt ont abouti à sa perte. Cela a été annoncé par une source dans la commission d'enquête étudiant les causes de l'accident de la station interplanétaire.
Les tests des équipements réalisés par la commission ont démontré que l'ordinateur central de la station était surchargé après sa mise sur orbite autour de la Terre. Cela a provoqué une défaillance et a imposé le rechargement de l'ordinateur. En résultat la station n'a pas effectué la manoeuvre nécessaire pour se mettre sur l'orbite vers Mars.
Des tentatives multiples des services terrestres d'établir la liaison avec la station ont eu pour effet que le transmetteur avait déchargé les piles de la station. En fin de compte celle-ci a cessé de fonctionner.
Ainsi la version sur l'action destructrice d'un radar américain sur les systèmes de Phobos-Grunt s'est avérée dénuée de fondement.
