L'appareil, un F/A-18 C monoplace, a été localisée par un hélicoptère de l'Armée de l'air, dans les environs du col du Susten, dans le centre de la Suisse, a expliqué le ministère dans un communiqué.
Toutefois, les autorités suisses n'ont pas encore pu emprunter la route pour se rendre sur les lieux où se trouve l'épave en raison des "conditions météorologiques défavorables", précise le communiqué.
Des alpinistes expérimentés sont prêts à se rendre sur place dès que la météo le permettra, relèvent les autorités.
Cet avion effectuait un exercice avec un deuxième avion, lorsque tous les contacts radio avec le pilote ont été coupés lundi à 16h05 (14H05 GMT), annonce l'AFP.